Package: GeneExprLupusMx
Title: Datos transcriptómicos de lupus en mujeres mexicanas con
        lecciones de aprendizaje
Version: 0.1.0.9000
Authors@R: 
    person(given = "Evelia", family = "Coss", 
      email = "ecossnav@gmail.com", 
      role = c("aut", "cre", "cph"),
      comment = c(ORCID = "0000-0002-7087-2977"))
Description: Paquete de datos con lecciones de aprendizaje bilingües
        (español e inglés). Incluye los perfiles transcriptómicos
        (RNA-seq) de monocitos, células dendríticas derivadas de
        monocitos (moDC) y células dendríticas tolerogénicas (tolDC) de
        33 mujeres mexicanas (10 controles sanas y 23 pacientes con
        lupus eritematoso sistémico; 99 muestras), sus metadatos
        clínicos y los resultados intermedios de cada análisis. Las
        lecciones reproducen paso a paso las figuras del artículo
        original, de la estadística descriptiva a la expresión
        diferencial, el enriquecimiento funcional y los modelos con
        interacción, y se acompañan de funciones auxiliares para
        heatmaps y la reducción de términos GO. Data package with
        bilingual learning lessons (Spanish and English) on the
        transcriptomics of lupus in Mexican women, designed for
        teaching and reproducible research.
License: MIT + file LICENSE
Encoding: UTF-8
Roxygen: list(markdown = TRUE)
URL: https://github.com/EveliaCoss/GeneExprLupusMx,
        https://eveliacoss.github.io/GeneExprLupusMx/
BugReports: https://github.com/EveliaCoss/GeneExprLupusMx/issues
Depends: R (>= 4.0)
Imports: tools, utils
LazyData: true
Language: en, es
LazyDataCompression: xz
Suggests: circlize, ComplexHeatmap, cowplot, DESeq2, dplyr, ggh4x,
        ggplot2, ggrepel, knitr, MASS, org.Hs.eg.db, rmarkdown, rrvgo,
        scales, SummarizedExperiment, testthat (>= 3.0.0), tidyverse,
        withr
biocViews:
Config/testthat/edition: 3
VignetteBuilder: knitr
Config/roxygen2/version: 8.1.0
Repository: https://ropensci-staging.r-universe.dev
Date/Publication: 2026-10-31 18:29:09 UTC
RemoteUrl: https://github.com/EveliaCoss/GeneExprLupusMx
RemoteRef: HEAD
RemoteSha: 368a4c6e77def00cac13595326be24a60a9aa8bb
NeedsCompilation: no
Packaged: 2026-10-31 18:47:04 UTC; root
Author: Evelia Coss [aut, cre, cph] (ORCID:
    <https://orcid.org/0000-0002-7087-2977>)
Maintainer: Evelia Coss <ecossnav@gmail.com>