Package: GeneExprLupusMx 0.1.0.9000

Evelia Coss

GeneExprLupusMx: Datos transcriptómicos de lupus en mujeres mexicanas con lecciones de aprendizaje

Paquete de datos con lecciones de aprendizaje bilingües (español e inglés). Incluye los perfiles transcriptómicos (RNA-seq) de monocitos, células dendríticas derivadas de monocitos (moDC) y células dendríticas tolerogénicas (tolDC) de 33 mujeres mexicanas (10 controles sanas y 23 pacientes con lupus eritematoso sistémico; 99 muestras), sus metadatos clínicos y los resultados intermedios de cada análisis. Las lecciones reproducen paso a paso las figuras del artículo original, de la estadística descriptiva a la expresión diferencial, el enriquecimiento funcional y los modelos con interacción, y se acompañan de funciones auxiliares para heatmaps y la reducción de términos GO. Data package with bilingual learning lessons (Spanish and English) on the transcriptomics of lupus in Mexican women, designed for teaching and reproducible research.

Authors:Evelia Coss [aut, cre, cph]

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GeneExprLupusMx/json (API)

# Install 'GeneExprLupusMx' in R:
install.packages('GeneExprLupusMx', repos = c('https://ropensci-staging.r-universe.dev', 'https://cloud.r-project.org'))

Reviews:rOpenSci Software Review #()

Bug tracker:https://github.com/eveliacoss/geneexprlupusmx/issues

Pkgdown/docs site:https://eveliacoss.github.io

Datasets:

On CRAN:

Conda:

bilingualbioinformaticsdata-packagedendritic-cellseducationlupusmexicoopen-datarna-seqspanishsystemic-lupus-erythematosustranscriptomics

3.60 score 7 exports 0 dependencies

Last updated from:368a4c6e77. Checks:10 OK. Indexed: no.

TargetResultTimeFilesSyslog
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pkgdown docsOK1165
source / vignettesOK284
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macos-releaseOK192
macos-oldrelOK213
windows-develOK217
windows-releaseOK194
windows-oldrelOK208
wasm-releaseOK141

Exports:create_heatmapdownload_dataget_heatmap_matprocess_goprocessGOreduce_go_termsReduce_GOTerm

Dependencies:

Get started with GeneExprLupusMx
What is GeneExprLupusMx? | Installation | What data does it contain? | How are they related? | Learning path | How to cite

Last update: 2026-10-31
Started: 2026-08-17

Primeros pasos con el paquete GeneExprLupusMx
¿Qué es GeneExprLupusMx? | Instalación | ¿Qué datos contiene? | ¿Cómo se relacionan? | Ruta de aprendizaje | ¿Cómo citar?

Last update: 2026-10-31
Started: 2026-08-17

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